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公司商标应在国家知识产权局商标局注册。
1、准备商标图样，确定注册范围并提交至商标局进行商标查询，以避免与已有商标重复或相似，这一步非常重要，因为它可以帮助避免未来可能出现的法律纠纷。
2、申请日提交商标材料后，商标局会进行形式审查，一般需要几个月的时间，如果审查成功，商标局会下发商标受理通知书，如果形式审查不通过，商标局会下发不予受理通知书，对于商标法禁止的某些内容，审查员会驳回相应的商品或服务项目，此时可以申请复审一次，如果仍不能获得通过，则商标注册申请终止，如果能通过形式审查，接下来会进入实质审查阶段，在这一阶段中，商标局会进行进一步的审查，包括检查商标注册申请是否具有可注册性、检查是否与在先申请存在冲突等，这一阶段可能需要大约一年左右的时间，如果实质审查通过，商标局会进行初步审定公告，如果遭到驳回，申请人也可以申请复审一次，如果仍不能获得通过，商标注册申请终止，如果初步审定公告无异议或异议已解决，商标将被核准注册并下发商标注册证书，商标正式受到法律保护，注册有效期为十年，到期前可以进行续展注册，在注册过程中还可以查询商标办理状态。
流程仅供参考，建议咨询专业的商标注册代理机构或律师以获取具体的帮助和指导，商标注册流程可能因地区或国家的不同而有所差异。